2025年全球Top加密货币交易所权威推荐利用单细胞转录组解析拟南芥早期细胞转录图谱

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  为了进一步分析子叶叶脉的发育调控机制,研究进一步分析了特定组织细胞的转录因子调控网络(图 3)。如图 3a-c 所示,在 PP、CC_4 和 XP 中鉴定到的核心转录因子分别是CDF5、ERF15 和 RGA。进一步 DNA 亲和纯化测序(DAP-seq)分析表明,CDF5 在 BZIP9、SWEET12 和 SULTR2;1 的启动子区域以及 SWEET11 的编码序列(CDS)区域显著富集(图3e-g),表明这些基因的表达可由 CDF5 调节。对 CDF5 靶基因的 GO 分析表明,它们主要参与调解激素刺激、韧皮部或木质部组织发生和昼夜节律(图3h)。为了更好地理解CDF5在PP发育中的潜在作用,研究筛选了cdf5突变体。如图3i所示,cdf5 突变体中静脉的发育模式与WT相似。然而在cdf5突变体中,相比WT 而言,BZIP9、SWEET11、SWEET12 和 SULTR2;1的表达发生了不同程度地下降(图 3j),表明CDF5可能通过调节这四个靶基因的表达参与调节叶脉的功能。事实上,已有研究表明,这些基因主要参与调节叶脉的功能,而不是其发育[8-10]。

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